Organizacione jedinice uprave su:
1. Sektor za zaštitu tržišta i ekonomije, igre na sreću, javne nabavke
2. Sektor za zaštitu životne sredine, bezbjednosti i zdravlja ljudi, socijalne i dječje zaštite
3. Sektor za zaštitu državnih resursa
4. Sektor za zaštitu djelatnosti od javnog interesa
5. Sektor za međunarodnu saradnju
6. Sektor za zastupanje i pružanje stručne i druge pomoći u vršenju inspekcijskog nadzora
7. Služba za ljudske i materijalne odnose
8. Služba za inspekcijske informacione sisteme i izvještavanje u okviru inspekcijskog nadzora
9.Služba za opšte poslove i finansije
10. Odjeljenje za unutrašnju reviziju